1、畜禽糞便類：牛、羊、豬、雞等畜禽的糞便，能將其中的有機物質(zhì)分解轉化，去除臭味，殺死病菌和蟲卵，生產(chǎn)出無害化的有機肥料。

2、農(nóng)業(yè)廢棄物類

2.1農(nóng)作物秸稈：如玉米秸、麥桿、稻桿等，可分解秸稈中的纖維素等復雜有機物，使其轉化為可被植物吸收的營養(yǎng)物質(zhì)，用于堆肥還田，提高土壤肥力。

2.2油枯下腳料：如菜籽餅、棉籽餅等油枯，發(fā)酵后能將其中的蛋白質(zhì)、油脂等成分分解轉化，成為有機肥料。

3、工業(yè)廢渣類

3.1釀造廢渣：如啤酒廠的酒糟、白酒廠的酒渣等，含有豐富的有機物質(zhì)，通過發(fā)酵可以將其轉化為有價值的肥料或飼料原料。

3.2醋渣、糠醛渣、菌渣：這些工業(yè)廢渣經(jīng)過人元生物發(fā)酵菌的作用，可實現(xiàn)資源的再利用，轉化為可用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的有機物料。

4其他有機廢棄物類：果渣等也可以用其人元生物發(fā)酵菌進行發(fā)酵處理，將其中的糖分、纖維素等物質(zhì)分解，制成有機肥料或用于其他用途。